在深入学习实践科学发展观活动中，南昌工程学院立足高起点开局、高标准定位、高质量推进，紧密结合学院实际，在“水”字上做文章，在“用”上下功夫，系统地提出学院科学发展的新思路。
该院以“五早”为抓手，即学习辅导早安排、群众参与早发动、调研课题早确定、调研活动早开展、意见建议早收集，全面理清学院的发展思路。首先，认真梳理分析所征集的117个选题，确定10个校级和13个重点选题，由院领导牵头负责深入调研。其次，在全院开展解放思想大讨论，广开言路、问计于民，共收集意见建议423条。
在此基础上，该院提出了近期乃至更长一段时期科学发展新思路。这就是：深化改革与创新，探索一种符合学校定位的应用型人才培养模式；从理论教学和实践教学入手，完善应用型人才培养的二个课程体系；加大人才引进和培养力度，打造适应应用型人才培养要求的教学、科研和管理三支队伍；坚持“特色学科专业重点发展、优势学科专业优先发展、人无我有学科专业统筹发展、市场急需学科专业加快发展”四项原则；夯实“学科、专业、课程、实践教学平台、人才队伍”五项基础建设；统筹协调教学与科研、重点与一般、规模结构与质量效益等六个关系；重点实施重点学科、特色专业、精品课程等八项建设工程。
